En tant qu'agence pour la promotion de l'innovation de la Confédération, la CTI encourage la recherche appliquée et développement (Ra&D), la promotion de l'entrepreneuriat et le développement de jeunes entreprises. Elle contribue à l'optimisation du transfert de savoir et de technologie (TST) par le biais de réseaux thématiques nationaux (RTN) .
La CTI encourage
- les projets R&D orientés vers le marché ;
- la création et le développement de start-up ;
- le transfert de savoir et de technologie.
L'encouragement de projets R&D concerne en principe toutes les disciplines liées à l'innovation basée sur la science. Les demandes sont déposées conformément au principe bottom-up. Le contenu innovant et les perspectives de commercialisation réussie sont deux éléments déterminants pour l'encouragement.